Rekstur Þúfunnar er fjármagnaður samkvæmt samningi með fjárframlögum frá Reykjavíkurborg og Velferðarráðuneytinu.
Þúfan nýtur jafnframt góðs af framlagi frá ýmsum velunnurum sem hafa lagt fram sinn stuðning með ýmsum hætti, hvort sem það er með beinum fjárframlögum, með sinni vinnu eða öðrum hætti.
Starfsemin er fjármögnuð með styrkjum og frjálsum framlögum einstaklinga og lögaðila.
Kennitala: 500223-1460
Reikningsnúmer: 0515-14-007651